Образована решением Синода от 6 октября 2011 г. в пределах Иркутской области. Включает Братскую (см. статью Братская и Усть-Илимская епархия), Иркутскую (см. статью Иркутская и Ангарская епархия) и Саянскую (см. статью Саянская и Нижнеудинская епархия) епархии. Главой Иркутской митрополии был назначен архиепископ Иркутский и Ангарский Вадим (Лазебный; с 8 октября 2011 в сане митрополита).
26 декабря 2019 г. митрополит Вадим переведен на Ярославскую и Ростовскую кафедру и назначен главой Ярославской митрополии. Иркутскую кафедру возглавил архиепископ Максимилиан (Клюев; с 3 января 2020 в сане митрополита).