Образована решением Свящ. Синода от 6 июня 2012 г. путем выделения из состава Омской епархии. Включена в состав Омской митрополии. Правящему архиерею Синод постановил иметь титул Исилькульский и Русско-Полянский.
Объединяет приходы в административных границах Исилькульского, Любинского, Москаленского, Называевского, Нововаршавского, Одесского, Павлоградского, Полтавского, Русско-Полянского и Шербакульского районов Омской области.
Временным управляющим назначен митрополит Омский и Таврический Владимир (Иким).
Решением Свящ. Синода от 25 июля 2014 г. епископом Исилькульским и Русско-Полянским назначен еп. Феодосий (Гажу).